Šiaulių universiteto Matematikos ir informatikos fakultetas įkurtas 2005 m. liepos 1 d. padalijus Fizikos ir matematikos ir informatikos fakultetą (įsteigtas 1954 m.) į du: Matematikos ir informatikos fakultetą ir Gamtos mokslų fakultetą. Fakultete šiuo metu yra dvi katedros: Informatikos ir Matematikos.

Šiaulių universiteto Matematikos katedra jau keturis dešimtmečius (nuo 1970 metų) kasmet organizuoja Jaunųjų matematikų varžybas IX–XII klasių mokiniams. Kiekvienais metais susirenka apie 500 mokinių iš maždaug 30 rajonų. Fakultete 1997 m. įkurta Jaunųjų kompiuterininkų mokykla, į kurią priimami 10-tų klasių mokiniai. Jiems sudaromos sąlygos pasirengti tapti programuotojais, grafikos dizaineriais, tinklalapių kūrėjais. Mokiniams tai galimybė pasinerti į gilesnes mėgstamo dalyko studijas, dėstytojams ir universitetui - tai lyg „nulinis“ būsimų informatikos specialistų kursas. Į mokyklos pirmąjį kursą susirenka jaunuoliai iš įvairių Lietuvos miestų ir miestelių - Šiaulių, Kelmės, Mažeikų, Naujosios Akmenės, Radviliškio bei kitų. Po metų šie moksleiviai, pereidami į aukštesnį kursą, renkasi vieną iš pasiūlytų specializacijų. Kasmet, kai mokyklą baigia vyresnysis kursas, JKM papildo gausus būrys įstojusių dešimtokų.

Fakultete intensyviai vykdoma mokslinė veikla. Fakultete vyksta moksliniai seminarai. Pranešimus skaito fakulteto dėstytojai, doktorantai ir svečiai iš kitų Lietuvos bei užsienio mokslo institucijų.

Nuo 1998 m. leidžiamas žurnalas „Šiauliai Mathematical Seminar“ (iki 2006 m. jis buvo vadinamas „Fizikos ir matematikos fakulteto mokslinio seminaro darbai"). Tai – recenzuojamas ir referuojamas tarptautinėse duomenų bazėse leidinys. Redaktorių kolegijos nariai yra ne tik Lietuvos, bet ir užsienio šalių matematikai. Vyriausias redaktorius – prof. habil. dr. A. Laurinčikas, vykdančioji redaktorė – doc. dr. R. Kačinskaitė. Straipsniai, publikuojami žurnale, apima įvairias matematikos krypties šakas. 

2010 m. birželio 17-18 d. Šiaulių universiteto Matematikos ir informatikos fakultete organizuota Lietuvos matematikų draugijos LI konferencija, kurioje pristatyti 145 pranešimai, o dalyvavo 171 mokslininkas.

Kiekvienas metais fakultete studijas baigia apie 80 studentų, kurie įgyja matematikos, informatikos bakalauro ar magistro kvalifikacinį laipsnį, kai kuriems jų suteikiama mokytojo profesinė kvalifikacija. Fakulteto absolventai dirba prestižinėse valstybinėse arba privataus verslo institucijose, kai kurie pradeda savo verslą.

Fakulteto absolventės dr. Rasos Steuding (buvusi Šleževičienė), Wiesbaden'o (Vokietija) aukštosios mokyklos Dizaino-Informatikos-Medijų fakulteto mokslo darbuotojos, pasisakymas: 
„1996 metais baigiau Šiaulių pedagoginio instituto (dabar Šiaulių universiteto) Matematikos ir informatikos studijų programą ir įgijau matematikos mokslų bakalauro laipsnį bei matematikos ir informatikos mokytojo kvalifikaciją. Po metų tęsiau studijas Matematikos magistrantūroje, 1999 metais man buvo suteiktas socialinių mokslų magistro laipsnis bei gimnazijos matematikos mokytojo kvalifikacija. Bakalauro ir magistro studijų metu įgytas išsilavinimas suteikė galimybę tęsti mokslinius tyrimus Vilniaus universitete Matematikos krypties doktorantūroje, ją sėkmingai baigiau 2002 metais apgindama fizinių mokslų (matematikos) disertaciją "Rymano ir kitų dzeta funkcijų daugiamatės ribinės teoremos ir universalumas". Manau, kad studijos Šiaulių universitete gerai parengė ir pedagoginiam darbui."